猪既是重要的肉用家畜，又是良好的潜在生物医学模型动物。但是，随着猪相关研究课题的进展，越来越多的学者们意识到猪早期胚胎发育方面的解析远不如小鼠清晰的事实已经构成猪在生物医学模型方面发展的瓶颈。现有技术对于猪囊胚细胞染色存在染色效率较低、染色周期长等缺陷，本发明提供了一种简易快速的猪囊胚差异染色方法。